基于云計(jì)算的蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
所屬分類(lèi)：技術(shù)論文
上傳者：wwei
文檔大小：3619 K
標(biāo)簽： 云計(jì)算 蛋白質(zhì)折疊 空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
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文檔介紹：構(gòu)建基于云計(jì)算的蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)框架，通過(guò)數(shù)據(jù)云存儲(chǔ)設(shè)備獲取蛋白質(zhì)序列原始數(shù)據(jù)，采用HDFS（Hadoop Distributed File System）分布式存儲(chǔ)方式保存于云端。資源和隊(duì)列管理器RQM（Resource Queue Management）開(kāi)啟云端虛擬機(jī)后，以之作為掃描節(jié)點(diǎn)（Sensor Node， SN），SN基于二維AB非格點(diǎn)模型建立最小蛋白質(zhì)分子能量?jī)?yōu)化函數(shù)，采用局部搜索機(jī)制改進(jìn)的量子遺傳算法對(duì)其作優(yōu)化求解。利用云端GPU設(shè)備處理模型訓(xùn)練數(shù)據(jù)，即可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)的自動(dòng)化預(yù)測(cè)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明：蛋白質(zhì)序列能量勢(shì)函數(shù)計(jì)算結(jié)果更小、執(zhí)行效率更高、GDT-TS（Geothermal Development and Testing Tool Suite）評(píng)價(jià)指標(biāo)值更大。
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