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基于MapReduce框架下的復雜網(wǎng)絡社團發(fā)現(xiàn)算法
2014年微型機與應用第22期
于靜雯1, 楊 冰2
(1.遼寧師范大學 計算機與信息技術學院,遼寧 大連 116081; 2.大連醫(yī)科大學 附屬第一醫(yī)院,遼寧 大連 116011)
摘要: 隨著社會網(wǎng)絡數(shù)據(jù)的增加,社團發(fā)現(xiàn)獲得來自學術界和工業(yè)界的大量關注,是因為它在現(xiàn)實世界中有許多的實際應用。格文-紐曼(Girvan-Newman,GN)是現(xiàn)今最流行的算法之一,但在大型網(wǎng)絡上由于需要計算網(wǎng)絡中每對節(jié)點之間的最短路徑而產(chǎn)生了相應的局限性。為此,利用MapReduce模型,提出了一種并行版本的GN算法來支持大規(guī)模網(wǎng)絡的新方法,稱之為最短路徑之間的MapReduce算法(Shortest Path Betweenness MapReduce Algorithm,SPB-MRA)。此外,還提出了一個近似技術,進一步加快社區(qū)檢測過程。在Hadoop上利用開源平臺MapReduce框架實現(xiàn)了SPB-MRA算法。結果表明,隨著reducer數(shù)量的增加時間呈線性減小,并且引入了一種近似技術可以忽略誤差。
Abstract:
Key words :

  摘  要: 隨著社會網(wǎng)絡數(shù)據(jù)的增加,社團發(fā)現(xiàn)獲得來自學術界和工業(yè)界的大量關注,是因為它在現(xiàn)實世界中有許多的實際應用。格文-紐曼(Girvan-Newman,GN)是現(xiàn)今最流行的算法之一,但在大型網(wǎng)絡上由于需要計算網(wǎng)絡中每對節(jié)點之間的最短路徑而產(chǎn)生了相應的局限性。為此,利用MapReduce模型,提出了一種并行版本的GN算法來支持大規(guī)模網(wǎng)絡的新方法,稱之為最短路徑之間的MapReduce算法(Shortest Path Betweenness MapReduce Algorithm,SPB-MRA)。此外,還提出了一個近似技術,進一步加快社區(qū)檢測過程。在Hadoop上利用開源平臺MapReduce框架實現(xiàn)了SPB-MRA算法。結果表明,隨著reducer數(shù)量的增加時間呈線性減小,并且引入了一種近似技術可以忽略誤差。

  關鍵詞: Hadoop;MapReduce;社區(qū)檢測;GN算法;SPB-MRA

0 引言

  社會網(wǎng)絡服務(SNS網(wǎng)站),如Facebook和Twitter,在實際生活中變得越來越流行。因此分析社會網(wǎng)絡數(shù)據(jù)就成為各領域面對的最重要的問題之一。在這些分析工作中,社會網(wǎng)絡數(shù)據(jù)的社團發(fā)現(xiàn)在社會生活中有著實際的應用,因此獲得來自學術界和各行業(yè)的廣泛關注。由格文和紐曼[1]提出格文-紐曼(GN)算法引入邊介數(shù)的概念,用來衡量中心性和網(wǎng)絡中邊緣的影響度。雖然GN算法被廣泛應用,但當它支持大型網(wǎng)絡時,由于需要計算每對節(jié)點之間的最短路徑而具有局限性,而且節(jié)點對的數(shù)量也是有限制的。在大數(shù)據(jù)時代,可用的數(shù)據(jù)量空前增長,因此,數(shù)據(jù)分析是一種良好的可擴展方法,可以用來處理大型數(shù)據(jù)集。MapReduce是一個用于處理大數(shù)據(jù)集的并行編程模型,分布式聚類算法在MapReduce中可擴展性和易于使用的性質(zhì)[2-4]而得到廣泛的應用,這也是近年來在背后驅(qū)動分析大數(shù)據(jù)的動力。本文提出了一個并行版本的GN算法,即SPB-MRA算法來支持大規(guī)模的網(wǎng)絡,并且提出了一種近似技術來進一步加快社區(qū)檢測過程。

1 背景

  1.1 MapReduce和Hadoop[5]

  MapReduce并行的方式是一個加工大規(guī)模數(shù)據(jù)的編程模型[2]。用戶可以輕松地通過編寫map和reduce兩個函數(shù)實現(xiàn)分布式并行處理的功能。map函數(shù)處理數(shù)據(jù)輸入和鍵值對<key,value>,reduce函數(shù)是把具有相同key的value值進行合并后輸出。

  1.2 GN算法

  GN算法是分裂的分層聚類算法,利用邊界數(shù)[1]的概念。在提出的三種計算邊界數(shù)的方法中計算最短路徑的結果是最好的。邊界數(shù)是指經(jīng)過兩個節(jié)點之間的最短距離的值。由于社團是由一些“組間”邊界松散地鏈接而成的,在不同社團之間所有最短路都必須經(jīng)過這些“組間”邊,這些邊連接起來的社團的邊界數(shù)將會很大,因此,社團可以通過不斷檢測來排除這些邊。從每對節(jié)點中最獲得最短路徑,所以GN算法的代價是非常高的。

2 算法

  SPB-MRA經(jīng)歷了4個并行計算的階段,每個階段執(zhí)行自己的map和reduce任務。在每次迭代中,第一階段會執(zhí)行多次,而其他階段只執(zhí)行一次。運行這4個階段直到結果的質(zhì)量不再有所改進。在社團發(fā)現(xiàn)中每對節(jié)點由7個元素組成的元組構成,元組中包含網(wǎng)絡結構(例如鄰接表),這時最短路徑通過元組獲得。

  targetid表示一個目的節(jié)點的最短路徑且最初設置為sourceid。sourceid表示最短路徑源節(jié)點且最初設置為targetid。distance表示最短路徑的長度,初值為0,每次迭代過程中更新第一階段的distance值。status表示一個特定的路徑的狀態(tài)。a表示積極的(active);i表示不積極的(inactive),意味著最短的路徑已檢測到。weight表示從sourceid到targetid最短路徑的數(shù)目且最初設置為1。pathinfo表示最短路徑經(jīng)過的節(jié)點的列表,初始值為空。adjlist表示targetid中相鄰的節(jié)點的列表。

  2.1 第一階段:找到所有節(jié)點對之間的最短路徑

  在第一階段,采取Zeng Zengfeng等人[6]提出的由一種多源消息傳遞模型的方法來計算每對節(jié)點之間的最短路徑。在map階段中輸入一個元組,若它的status是i,無需后續(xù)操作;若status是a,則改成i,距離加1并將targetid增加到pathinfo中;該元組被送到reduce階段。通過給在鄰接表中的每個點分配targetid即可生成新的元組。這些新生成的元組其status被設置為a,鄰接表被設置為空,并且其他元素被設定為那些發(fā)送前的元組的狀態(tài),如圖1所示。

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  2.2 第二階段:計算邊界數(shù)

  在第二階段,計算網(wǎng)絡中每對節(jié)點之間的邊界數(shù)。在map階段,整體根據(jù)最短路徑的sourceid和targerid的數(shù)目(即權重)被劃分成某條最短路徑上的邊。在reduce階段,每個邊由每個最短路徑的分量相加得到,如圖2所示。

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  2.3 第三階段:選擇要刪除的邊緣

  在第三階段,kiter邊按邊界數(shù)選擇。kiter是由用戶作為調(diào)節(jié)參數(shù)而指定的。在map階段,不需要進行后續(xù)操作。在reduce階段,邊按照邊界數(shù)的遞減順序排序,并且top-kiter邊緣被選定。只要運行一個reducer即可得到一個整體的排序結果,如圖3所示。

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  2.4 第四階段:刪除邊

  在第四階段,把網(wǎng)絡中在第三階段選擇的邊刪除,但在下一次迭代中,一個新的元組集合的生成表明需要重新計算刪除邊的邊界數(shù)。注意,如果一個最短路徑包含被去除邊,邊界值就會改變,那么邊界數(shù)將會發(fā)生變化。在map階段,如果第二階段分組中的targetid影響到第三階段邊緣的選擇,如果刪除相應節(jié)點來表示新的網(wǎng)絡結構,則它的鄰接表就會更新,其他的元組在下一次迭代中初始化,如圖4所示。在reduce階段,在鄰接表里的元組都會有一個更新的值,這些元組將作為下一次第一階段中的輸入而提供數(shù)據(jù),如圖5所示。

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3 性能試驗

  3.1 數(shù)據(jù)和環(huán)境

  采用來自于Stanford Large Network Dataset Collection[7]上的ca-GrQc和ca-HepTH兩組數(shù)據(jù)集,使用Java 1.6.0和Hadoop 1.0.4實現(xiàn)SPB-MRA。在亞巴遜彈性計算(Amazon EC2)利用m1.xlarge進行性能測試。Amazon EC2是由亞馬遜公司提供的Web服務,用戶可以租用其云電腦運行時所需要的相應系統(tǒng)。

  3.2 可擴展性

  為了顯示SPA-MRA的可擴展性,經(jīng)過一次迭代的同時reducer的數(shù)量從1變?yōu)?2,結果如圖6和圖7所示。

  隨著reducer的數(shù)量增加到8,所用的時間呈線性減少。對于這些數(shù)據(jù)集來說,reducer的數(shù)量是足夠的,過多的reducer就會變得無效??梢钥闯?,CA-HepTh數(shù)據(jù)集的大小是CA-GrQc數(shù)據(jù)集的兩倍,而圖7中的曲線要比圖6中的曲線率先變得平緩。

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  為了顯示SPA-MRA近似值的精度,在不同的kiter值下測量F-score[8]的值,如表1所示。其中,kiter表示一次迭代中要刪除邊緣的數(shù)量。在表1中,雖然一次性刪除40條邊F-score值只減少了10%,但是它證明4次提速卻只有10%的誤差。

4 結論

  本文提出了一個并行版本的GN算法即SPB-MRA來支持大規(guī)模的網(wǎng)絡,并利用MapReduce模型在Hadoop平臺上得到了實現(xiàn)。在亞馬遜的EC2上進行了實例SPB-MRA性能試驗,結果表明,隨著reducer數(shù)量的增加時間呈線性減少,并且逼近值技術的錯誤率可以忽略不計。未來的工作是進一步提高SPB-MAR的性能,引入額外的近似技術。

參考文獻

  [1] NEWMAN M E, GIRVAN M. Finding and evaluating community structure in networks[J]. Physical Review E, 2004,69(2):026113-1-026113-15.

  [2] DEAN J, GHEMAWAT S. MapReduce: simplified data processing on large clusters[C]. Communications of the ACM, 2008,51(1):107-113.

  [3] CHAIKEN R, JENKINS B,  LARSON P.-A°, et al. Scope: easy and efficient parallel processing of massive data sets[C].Proceedings of the VLDB Endowment, 2008,1(2):1265-1276.

  [4] COHEN J, DOLAN B, DUNLAP M, et al. Mad skills: new analysis practices for big data[C]. Proceedings of the VLDB Endowment, 2009,2(2):1481-1492.

  [5] Hadoop Apache. Software Foundation.(2013-08-01)[2014-07-01].http://hadoop.apache.org.

  [6] Zeng Zengfeng, Wu Bin, Zhang Tiantian. A multi-source message passing model to improve the parallelism efficiency of graph mining on MapReduce[C]. Proceedings of 2012 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops & PhD Forum(IPDPSW),2012:2019-2025.

  [7] Stanford large network dataset collection[EB/OL].[2013-08-01]. http://snap. stanford.edu/data.

  [8] Han Jiamei, KAMBER M, Pei Jian. Data mining: concepts and techniques(2nd edition). Morgan Kaufmann, 2006.


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