CUDA加速的DNA-蛋白質(zhì)匹配及其優(yōu)化
所屬分類：技術(shù)論文
上傳者：aet
文檔大?。?span>527 K
標(biāo)簽： DNA-蛋白質(zhì)匹配 統(tǒng)一計(jì)算設(shè)備架構(gòu) 退火算法
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文檔介紹：設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)了一種使用統(tǒng)一計(jì)算設(shè)備架構(gòu)(CUDA)加速DNA-蛋白質(zhì)匹配的方法。詳細(xì)介紹了一種基于退火算法的DNA-蛋白質(zhì)匹配方法和CUDA的特點(diǎn)，從計(jì)算的角度對(duì)匹配方法進(jìn)行了分析?；贑UDA設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)并行化方法，并根據(jù)CUDA的線程調(diào)度策略對(duì)并行方法進(jìn)行了優(yōu)化。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，最大可獲得15倍左右的加速比。
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