基于拓撲結(jié)構(gòu)的度量學(xué)習(xí)與拓撲傳播的miRNA-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測算法
所屬分類：技術(shù)論文
上傳者：wwei
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標(biāo)簽： 深度學(xué)習(xí) miRNA-疾病關(guān)聯(lián) 度量學(xué)習(xí)
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文檔介紹：miRNA的突變和異常表達可能導(dǎo)致各種疾病，因此預(yù)測miRNA與疾病的潛在相關(guān)性對于臨床醫(yī)學(xué)和藥物研究的發(fā)展具有重要意義。拓撲結(jié)構(gòu)是miRNA-疾病預(yù)測算法的重要組成部分，然而當(dāng)前算法并未有效利用拓撲結(jié)構(gòu)導(dǎo)致預(yù)測結(jié)果并不理想。與此同時，如何有效地融合多源數(shù)據(jù)也是當(dāng)前的研究趨勢。針對上述問題，提出一種自適應(yīng)融合異質(zhì)節(jié)點結(jié)構(gòu)信息算法（MMTP），通過利用節(jié)點的一階鄰居和元路徑誘導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)結(jié)構(gòu)特征，并利用度量學(xué)習(xí)和拓撲傳播自適應(yīng)地融合異質(zhì)節(jié)點結(jié)構(gòu)信息，以提升miRNA-疾病預(yù)測精度。5折交叉驗證實驗結(jié)果表明，MMTP在HMDD v3.2數(shù)據(jù)集上的受試者操作曲線下面積（AUC）為94.81，高于其他模型。并且在基于腎癌的案例研究中，該模型所預(yù)測的前30個miRNAs全部得到證實。上述研究證明，所提的MMTP模型可有效預(yù)測miRNA-疾病相關(guān)性。
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