逄淑玲,王曉升
?。ㄉ綎|女子學(xué)院 信息技術(shù)學(xué)院,山東 濟(jì)南 250300)
摘要:文章研究了一種多核架構(gòu)下基于OpenMP的Dijkstra并行算法,以Dijkstra算法為基礎(chǔ)設(shè)計(jì)并行程序。對傳統(tǒng)Dijkstra算法進(jìn)行分析,明確優(yōu)化方向,再利用OpenMP開發(fā)工具對并行程序進(jìn)行優(yōu)化調(diào)試。結(jié)果表明,文中算法易于操作,并充分利用了多核處理器并行計(jì)算的優(yōu)勢,提高了算法的運(yùn)行效率,驗(yàn)證了算法的優(yōu)越性。
關(guān)鍵詞:多核;Dijkstra算法;OpenMP;并行算法
中圖分類號(hào):TP312文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:ADOI: 10.19358/j.issn.1674-7720.2017.09.008
引用格式:逄淑玲,王曉升.Dijkstra算法的并行實(shí)現(xiàn)[J].微型機(jī)與應(yīng)用,2017,36(9):25-27.
0引言
隨著多核的發(fā)展,串行執(zhí)行程序的缺點(diǎn)暴露無遺,傳統(tǒng)的Dijkstra算法是串行算法,搜索過程易懂,程序設(shè)計(jì)簡單,但大量內(nèi)存空間與計(jì)算時(shí)間的耗費(fèi)成為此算法的瓶頸,而有效解決的途徑之一就是并行計(jì)算。為將計(jì)算能力最大化,需將一個(gè)應(yīng)用程序劃分為多個(gè)相對獨(dú)立的任務(wù)并交由多個(gè)計(jì)算核執(zhí)行。為從語言成分上直接支持并行,完全擺脫串行語言的束縛,設(shè)計(jì)了一種全新的程序設(shè)計(jì)模型,該并行算法與以往傳統(tǒng)算法相比能夠更有效地提高運(yùn)行效率,充分發(fā)揮高性能多核處理器的功效。
1OpenMP
OpenMP是一種支持跨平臺(tái)共享內(nèi)存方式的多線程并發(fā)編程模型,開發(fā)過程中無需考慮數(shù)據(jù)分布,具有良好的可移植性、可擴(kuò)展性,同時(shí)支持C、C++和FORTRAN語言。OpenMP提供一系列體系結(jié)構(gòu)和編程平臺(tái),建立簡潔高效的編程指導(dǎo)命令和并行編程方式,并提供各類串行程序并行化的可行方案[1]。OpenMP不是獨(dú)立的并行語言,通過在適當(dāng)位置加入編譯指令和運(yùn)行庫函數(shù)來并行化串行程序。OpenMP從主線程開始執(zhí)行,一直串行地執(zhí)行該線程,當(dāng)線程某些點(diǎn)需要并行執(zhí)行時(shí),程序則派生出額外的線程,組成一個(gè)線程組,這些線程在并行域的代碼區(qū)中并行執(zhí)行,線程到達(dá)整個(gè)并行區(qū)域的末尾時(shí)等待,直到整個(gè)線程組都到達(dá),最終相連接,這時(shí)只有主線程繼續(xù)執(zhí)行直到下一個(gè)并行區(qū)域或程序結(jié)束[2]。舉例說明[3]:
int main(int argc,char*argv[]){
#pragma omp parallel for
for(int i=0;i<10;i++)
{
printf(“i=%d/n”,i);
}
printf(“finished.\\n”);
return 0;
}
這段程序就是使用OpenMP編譯指導(dǎo)語句“#pragma omp parallel for”將for循環(huán)里的內(nèi)容并行執(zhí)行,從而提高效率。
2Dijkstra最短路徑算法
2.1算法思想
Dijkstra算法是典型的單源最短路徑,以起始點(diǎn)為中心向外層層擴(kuò)展,直到拓展到終點(diǎn)為止。假設(shè)Len(v)表示一個(gè)頂點(diǎn)到給定頂點(diǎn)U的最短距離,w(u,v)表示兩個(gè)頂點(diǎn)間的距離。給出兩個(gè)頂點(diǎn)V1、V2,求兩頂點(diǎn)之間最短距離。算法描述如下[4]:
?。?)給定頂點(diǎn)V1,標(biāo)記這個(gè)頂點(diǎn)并初始化所有的頂點(diǎn),將頂點(diǎn)V1放入集合S。
(2)對于集合S中的所有頂點(diǎn)Vi,計(jì)算Vi相鄰的所有頂點(diǎn)Uj的md(ui,vi)=w(ui,vj)+Len(vj)值并找出最小的md(u,v)值的頂點(diǎn)U,將頂點(diǎn)U放入集合S中。
?。?)重復(fù)上述步驟,直到將目標(biāo)頂點(diǎn)V2放入集合S中,即可求出頂點(diǎn)V1到V2間的最短距離,得到最短路徑[5]。
Dijkstra最短路徑算法流程圖如圖1所示[4]。
2.2算法分析
通過對該算法的分析得出該算法的不足之處,在每次迭代中,未標(biāo)記節(jié)點(diǎn)以無序的形式存放在一個(gè)數(shù)組或一個(gè)鏈表內(nèi),每次選擇最短路徑節(jié)點(diǎn)都必須把所有未標(biāo)記節(jié)點(diǎn)掃描一遍,當(dāng)節(jié)點(diǎn)數(shù)目較大時(shí),這將成為制約計(jì)算速度的關(guān)鍵因素。
3基于OpenMP的并行Dijkstra算法
3.1算法的并行化思想
在編程時(shí),代碼并行執(zhí)行不僅限于某個(gè)函數(shù)的并行化,而是函數(shù)內(nèi)部也需創(chuàng)建線程使關(guān)鍵計(jì)算并行執(zhí)行。頻繁創(chuàng)建線程會(huì)使工作開銷額外增加[6],借助OpenMP在有效的并行化程序的同時(shí)也可解決多核編程時(shí)線程創(chuàng)建問題。
(1)Dijkstra并行算法設(shè)計(jì)思想
從Dijkstra最短路徑算法可看出,集合S每次循環(huán)迭代之后定點(diǎn)個(gè)數(shù)都會(huì)加1,每次迭代都依賴于上次迭代的結(jié)果,循環(huán)之間存在依賴關(guān)系,所以外層循環(huán)不能直接并行化[7],因此提出對內(nèi)層循環(huán)并行化。每個(gè)線程計(jì)算一個(gè)頂點(diǎn)的所有邊,從中取得最小邊并保存在一個(gè)數(shù)組的不同位置,然后從數(shù)組中找出最小的值,得到最近距離的一個(gè)頂點(diǎn)[8]。繼續(xù)執(zhí)行外層循環(huán),直到找到最近距離頂點(diǎn)和目標(biāo)節(jié)點(diǎn)為止。
(2)并行算法的程序設(shè)計(jì)流程圖[4]如圖2所示。
3.2并行算法設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)
Dijkstra算法的并行化通過兩部分實(shí)現(xiàn):Parallel_GetShortestPath()函數(shù)實(shí)現(xiàn)主算法流程,SearchNextVertex()函數(shù)實(shí)現(xiàn)并行計(jì)算第M個(gè)最近頂點(diǎn)的算法流程[9]。并行算法的實(shí)現(xiàn)代碼如下[4]:
#pragma omp parallel for
num_thread(pgraph>nnodecount,MIN_ITERATOR_NUM))
for(i=0; i<pGraph>nNodeCount; i++)
{
pGraph>ppNodeArray[i]->nMagic=-1;/*初始化為-1,表示未計(jì)算過最短路徑的總距離*/
pGraph>ppNodeArray[i]->pMagic=NULL;/*指針為空*/
}
ppSNode[0]=pSrcNode;
ppSNode[0]->nMagic=0; /*初始化為0*/
ppSNode[0]->pMagic=NULL;
for(x=1; x<pGraph>nNodeCount; x++)/*x從1開始循環(huán)執(zhí)行*/
{
DISTANCE nTotalDis;
GRAPHNODE *pTNode;
pTNode=NULL;
NTotalDisGRAPH_MAX_DISTANCE;
SearchNextVertex(pGraph,ppSNode,x,ppNode,pnDis);
INT index=-1;
for(i=0;i<x;i++)
{
if(nTotalDis>pnDis[i])
{
nTotalDis=pnDis[i];
index=i;
}
}
if(index !=-1)
{
pTNode=ppNode[index*2];
pTNode>nMagic=nTotalDis;
pTNode>pMagic=ppNode[index *2+1];
if(pTNode==pTagNode)
{
nTagDis=nTotalDis;/*計(jì)算出源節(jié)點(diǎn)到目標(biāo)節(jié)點(diǎn)的最短路徑*/
Break;
}
}
else{ /*最短路徑總是存在的,此處應(yīng)該不會(huì)被執(zhí)行*/
break;
}
ppSNode[x]=pTNode;
}
free(ppNode);
free(pnDis);
free(ppSNode);
return nTagDis; /*返回目標(biāo)節(jié)點(diǎn)到源節(jié)點(diǎn)的最短路徑*/
}
4實(shí)驗(yàn)與結(jié)果分析
為驗(yàn)證并行化后Dijkstra算法的性能,設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,分別采用傳統(tǒng)的Dijkstra算法與并行化的Dijkstra算法進(jìn)行實(shí)驗(yàn),測試了不同節(jié)點(diǎn)數(shù)和弧段數(shù)下運(yùn)行時(shí)間分析對比,評估出并行化后的性能[10],結(jié)果如表1所示。
從表1中可看出,在執(zhí)行相同節(jié)點(diǎn)數(shù)與弧段數(shù)的情況下,并行Dijkstra算法比串行Dijkstra算法更加省時(shí),大幅度提高了運(yùn)行速度。
5結(jié)論
本文對傳統(tǒng)Dijkstra算法進(jìn)行分析,為節(jié)省計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)空間,提高運(yùn)行效率,在OpenMP模型下對Dijkstra算法的并行設(shè)計(jì)進(jìn)行了研究,通過數(shù)據(jù)的采集與分析驗(yàn)證并行化后Dijkstra算法的性能,結(jié)果表明:該并行算法與以往傳統(tǒng)算法相比能夠更有效地提高運(yùn)行效率,充分發(fā)揮高性能多核處理器的功效。
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