《電子技術(shù)應(yīng)用》
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顯微細(xì)胞圖像有形成分分割方法研究
2015年微型機(jī)與應(yīng)用第17期
漆鵬杰1,劉秀波1,仲兆準(zhǔn)2
(1.蘇州大學(xué) 機(jī)電工程學(xué)院,江蘇 蘇州 215021; 2.蘇州大學(xué) 沙鋼鋼鐵學(xué)院,江蘇 蘇州 215021)
摘要: 本文研究了一種顯微細(xì)胞圖像有形成分分割方法。首先,利用傳統(tǒng)的邊緣檢測(cè)及閾值分割法對(duì)顯微細(xì)胞圖像有形成分進(jìn)行分割比較,然后基于顯微細(xì)胞圖像特點(diǎn)提出了一種改進(jìn)的二維最大熵閾值結(jié)合形態(tài)學(xué)分割方法。最后通過(guò)分割實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果表明利用本文方法能較好地實(shí)現(xiàn)顯微細(xì)胞圖像有形成分分割。所以本文提出的分割方法在醫(yī)學(xué)上具有一定的實(shí)用價(jià)值。
Abstract:
Key words :

  摘  要: 本文研究了一種顯微細(xì)胞圖像有形成分分割方法。首先,利用傳統(tǒng)的邊緣檢測(cè)及閾值分割法對(duì)顯微細(xì)胞圖像有形成分進(jìn)行分割比較,然后基于顯微細(xì)胞圖像特點(diǎn)提出了一種改進(jìn)的二維最大熵閾值結(jié)合形態(tài)學(xué)分割方法。最后通過(guò)分割實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果表明利用本文方法能較好地實(shí)現(xiàn)顯微細(xì)胞圖像有形成分分割。所以本文提出的分割方法在醫(yī)學(xué)上具有一定的實(shí)用價(jià)值。

  關(guān)鍵詞: 顯微細(xì)胞;有形成分;分割;熵值

0 引言

  顯微細(xì)胞是構(gòu)成人體的重要組成部分,廣泛存在于人體的血液、體液、尿液等樣本中。顯微細(xì)胞主要包括紅細(xì)胞、白細(xì)胞、上皮細(xì)胞、管型、結(jié)晶等,其結(jié)構(gòu)、形態(tài)、數(shù)量的變化都將影響人體機(jī)能的正常運(yùn)行,危害人體健康。顯微細(xì)胞檢測(cè)是醫(yī)院的一項(xiàng)重要的細(xì)胞檢測(cè)手段,它主要是通過(guò)在顯微鏡下觀察顯微細(xì)胞的數(shù)目、形態(tài)、大小等特征來(lái)判定人體的身體健康狀況。目前,醫(yī)學(xué)上大多采用傳統(tǒng)的人工檢測(cè)手段,這種方法是人工直接利用顯微鏡觀察樣本情況,其存在許多弊端:觀測(cè)時(shí)間較長(zhǎng),容易產(chǎn)生視覺(jué)疲勞;儀器、采樣等容易引起噪聲污染及模糊圖像;重復(fù)性差,難于標(biāo)準(zhǔn)化,不利于臨床動(dòng)態(tài)觀察[1-2]。這些弊端的存在使得醫(yī)學(xué)診斷的準(zhǔn)確性受影響,因此人工鏡檢已經(jīng)很難適應(yīng)醫(yī)院大批量的現(xiàn)代化檢測(cè)要求。而隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)以及機(jī)器視覺(jué)技術(shù)的飛速發(fā)展,基于機(jī)器視覺(jué)的顯微細(xì)胞圖像有形成分自動(dòng)識(shí)別技術(shù)不斷完善,醫(yī)學(xué)上逐步利用計(jì)算機(jī)的高效率、高準(zhǔn)確性特點(diǎn),將醫(yī)學(xué)工作和計(jì)算機(jī)視覺(jué)手段結(jié)合起來(lái),用于自動(dòng)診斷與識(shí)別。

  基于機(jī)器視覺(jué)的顯微細(xì)胞圖像有形成分自動(dòng)識(shí)別技術(shù)主要有圖像預(yù)處理、圖像分割、有形成分特征提取以及有形成分識(shí)別等技術(shù)。其中圖像分割在整個(gè)顯微細(xì)胞有形成分自動(dòng)識(shí)別中極為關(guān)鍵。由于顯微細(xì)胞圖像本身的成分特點(diǎn)以及在采集過(guò)程中各方面的影響,獲取的圖像容易混入噪聲,造成細(xì)胞顯微圖像光照不均、對(duì)比度低,這給顯微細(xì)胞有形成分的分割帶來(lái)了一定的難度[3]。本文主要針對(duì)顯微細(xì)胞圖像特點(diǎn),并通過(guò)研究和比較傳統(tǒng)的邊緣檢測(cè)法和閾值分割法,提出了一種二維最大熵閾值粗分割結(jié)合形態(tài)學(xué)二次分割的有形成分分割方法,較好地分割了顯微細(xì)胞圖像有形成分。

1 邊緣檢測(cè)分割方法

  圖像的邊緣是圖像最基本的特征,它在圖像分析中起著關(guān)鍵的作用。對(duì)于顯微細(xì)胞圖像有形成分而言,在細(xì)胞區(qū)域有著明顯的邊緣,即是像素點(diǎn)灰度值的變化,這種變化可以用微分算子檢測(cè)出來(lái),通常是以一階或者二階導(dǎo)數(shù)的方式,這就叫邊緣檢測(cè)。其中Roberts、Sobel、Prewitt是基于一階導(dǎo)數(shù)檢測(cè)的邊緣檢測(cè)算子,它們利用各自的模板作為核與圖像中的每個(gè)像素點(diǎn)做卷積和運(yùn)算,然后選取合適的閾值以提取邊緣。Laplace算子是基于二階導(dǎo)數(shù)檢測(cè)的邊緣檢測(cè)算子。Canny算子不屬于微分檢測(cè)算子范疇,它是在一定約束條件下推導(dǎo)出的邊緣檢測(cè)最優(yōu)化算子。

2 閾值分割方法

  為了實(shí)現(xiàn)閾值分割,需要將圖像劃分為目標(biāo)灰度集合和背景灰度集合,且兩個(gè)灰度集合可以用一個(gè)灰度級(jí)閾值進(jìn)行分割,這種用閾值分割灰度級(jí)的計(jì)算方法就是圖像的閾值處理。設(shè)圖像為f(x,y),其灰度范圍為[0,L-1],在0和L-1之間選擇一個(gè)合適的閾值T,則圖像分割方法可描述為:

  1.png

  在閾值分割中,閾值的選擇合適與否直接決定了圖像分割結(jié)果的準(zhǔn)確性?;陂撝档姆指罘椒ㄓ泻芏喾N,本節(jié)主要介紹直方圖雙峰法、迭代閾值法、Otsu閾值法。

  2.1 直方圖雙峰法

  在圖像的灰度直方圖上找出目標(biāo)與背景出現(xiàn)的高峰,兩高峰的低谷處即閾值。雙峰法的優(yōu)點(diǎn)是算法易于理解并容易實(shí)現(xiàn)[4]。但從效果圖上看,只有當(dāng)圖像的背景顏色與前景顏色相差較大時(shí),原始圖像分割效果較好。

  2.2 迭代閾值法

  迭代法是基于逼近的原理[5],圖像的最大灰度值為Max、最小灰度值為Min,則初始閾值為:

  T0=(Max+Min)/2(2)

  閾值Tk可將圖像劃分為目標(biāo)和背景,求出目標(biāo)和背景的平均灰度值為Z0和Zb,此時(shí)閾值為:

  Tk+1=(Z0+Zb)/2(3)

  如果Tk=Tk+1,則為所求閾值;反之利用式(3)進(jìn)行迭代計(jì)算。經(jīng)驗(yàn)證,利用迭代法進(jìn)行閾值分割的效果較好,可將圖像的目標(biāo)區(qū)域和背景區(qū)域合理地分離。但圖像的微小部分仍會(huì)存有缺陷。

  2.3 Otsu閾值法

  Otsu法[6]是一種使類間方差最大來(lái)自動(dòng)確定閾值的方法,其算法簡(jiǎn)單、速度快。設(shè)圖像有L個(gè)灰度級(jí),灰度級(jí)為i的像素為ni,則總的像素YXLDHJH_YR010HLHQM5_)7J.jpg,每個(gè)灰度級(jí)的概率為pi=ni/N,設(shè)灰度1~T級(jí)的像素B為背景區(qū)域,灰度級(jí) T+1~L-1的像素O為目標(biāo)區(qū)域。B和O的概率分別為:

  46.jpg

  T在[0,L-1]范圍內(nèi)依次取值,使得最大時(shí)的T值即為Otsu法的最佳閾值。

3 基于平滑后的二維最大熵閾值粗分割與形態(tài)學(xué)精細(xì)分割的結(jié)合

  3.1 改進(jìn)的二維最大熵閾值粗分割

  (1)顯微細(xì)胞圖像區(qū)域灰度特征包含了圖像的部分空間信息,并且對(duì)噪聲敏感程度相比點(diǎn)灰度特征較弱。因此利用顯微圖像的點(diǎn)灰度和區(qū)域灰度特征就可較好地表征顯微細(xì)胞圖像的信息,改善圖像的分割質(zhì)量,實(shí)現(xiàn)二維直方圖最大熵閾值分割[7]。

  設(shè)顯微細(xì)胞原圖像f(x,y)的灰度級(jí)數(shù)為L(zhǎng),圖像的大小為M×N,經(jīng)過(guò)對(duì)原圖進(jìn)行鄰域平均得到另一顯微細(xì)胞圖像g(x,y),它的灰度級(jí)仍為L(zhǎng),圖像大小不變。兩圖像灰度級(jí)共同構(gòu)成一個(gè)二元函數(shù)z(i,j)=[f(x,y),g(x,y)]M×N。設(shè)nij為圖像中點(diǎn)灰度為i及其區(qū)域灰度均值為j的像素點(diǎn)數(shù),pij為點(diǎn)灰度與區(qū)域灰度均值對(duì)(i,j)發(fā)生的概率,則:

  8.png

001.jpg

  用像素灰度等于s和鄰域平均灰度等于t的兩個(gè)值來(lái)劃分圖像二維灰度直方圖,如圖1為二維直方圖xoy平面圖,其中A和B分別代表目標(biāo)與背景(或相反),遠(yuǎn)離對(duì)角線的C和D代表邊界噪聲。

  定義二維離散熵為:

  9.png

  定義后每個(gè)區(qū)概率為PA、PB、PC、PD,那么:

  10.png

  相應(yīng)的A區(qū)域的二維熵為:

  11.png

  式中:

  12.png

  由于遠(yuǎn)離對(duì)角線的C和D區(qū)域包含關(guān)于噪聲和邊緣的信息,概率較小,可以忽略不計(jì),因此得到:

  1314.png

  熵的判別函數(shù)為:

  15.png

  該算法能夠克服因灰度分布集中,灰度直方圖呈現(xiàn)峰、谷不明顯以致難以獲取最佳閾值的缺陷。

 ?。?)在研究分析中發(fā)現(xiàn),利用此方法進(jìn)行分割耗時(shí)較長(zhǎng),主要是因?yàn)殚撝档倪x取是在二維空間中計(jì)算,復(fù)雜度大。這就需要對(duì)其進(jìn)行改進(jìn)來(lái)減少算法運(yùn)行時(shí)間。本文提出一種改進(jìn)閾值選取方法如圖2所示。

002.jpg

  以圖中的對(duì)角線為閾值把直方圖劃分為E、F兩個(gè)區(qū)域。將像素灰度值與鄰域平均灰度值小于N的所有的像素點(diǎn)劃分為一類,則大于N值為另外一類,分別代表圖像中的目標(biāo)和背景。此方法就是把像素灰度值和鄰域平均灰度值之和相等的像素點(diǎn)劃分為一組,劃分值以每個(gè)組為單位,即劃分值增加一個(gè)單位就會(huì)相應(yīng)地增加一組像素點(diǎn)。此類方法等效于先用均值濾波器對(duì)圖像做平滑處理,再對(duì)圖像進(jìn)行分割。

  將計(jì)算從二維簡(jiǎn)化為一維,此時(shí)只需計(jì)算圖2中E的PE和HE:

  1618.png

  熵的判定函數(shù)定義為:

  19.png

  在上式中其實(shí)是用沿對(duì)角線方向的分割線將直方圖分為2(L-1)條組帶,用在0~2(L-1)間變化的N作為劃分閾值,這就將二維復(fù)雜運(yùn)算降為一維,大大縮短了運(yùn)算時(shí)間,在平滑處理前與處理后的分割時(shí)間對(duì)比如表1所示。

006.jpg

  3.2 數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)二次精細(xì)分割

  在采用二維最大熵閾值分割方法分割顯微細(xì)胞圖像后,雖然能夠較好地提取顯微細(xì)胞的邊緣,但在顯微細(xì)胞圖像中出現(xiàn)了一些不是細(xì)胞區(qū)域的雜點(diǎn),并且邊界還會(huì)有微小斷裂以及細(xì)胞孔洞的存在。因此就要利用相關(guān)的方法進(jìn)行二次精細(xì)分割。本文利用數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)中開(kāi)閉操作以及填充的方法來(lái)完成顯微細(xì)胞圖像的精細(xì)分割。

  最終的分割流程:首先用中值濾波去除圖像中噪聲,再對(duì)顯微細(xì)胞圖像進(jìn)行平滑處理,有利于減少誤差和加快運(yùn)算速度;接著利用二維最大熵方法完成粗分割;最后用形態(tài)學(xué)方法完成精細(xì)分割。

4 顯微細(xì)胞圖像分割實(shí)驗(yàn)及分析

003.jpg

  在分析研究了不同的圖像分割方法之后,就要利用以上邊緣檢測(cè)方法以及閾值分割方法對(duì)顯微細(xì)胞圖像進(jìn)行分割實(shí)驗(yàn),利用邊緣檢測(cè)中的Sobel算子、Roberts算子以及Canny算子對(duì)顯微細(xì)胞圖像的分割效果如圖3所示。從圖中可以看到在利用邊緣檢測(cè)算子對(duì)顯微細(xì)胞圖像進(jìn)行分割的邊緣提取的效果較差,Sobel算子和Roberts算子提取的邊緣不夠完善,很多邊緣都是斷裂的;而利用Canny算子提取過(guò)于細(xì)致,許多噪聲點(diǎn)也被提取出來(lái),干擾太大。因此,利用邊緣檢測(cè)的方法不能很好地分割顯微細(xì)胞圖像。

004.jpg

  根據(jù)顯微細(xì)胞圖像的灰度直方圖,利用直方圖雙峰法、迭代閾值法及Otsu閾值法對(duì)顯微細(xì)胞圖像進(jìn)行分割,其分割結(jié)果如圖4所示。從圖中可以看到基于閾值分割方法同樣未能很好地分割出顯微細(xì)胞邊緣,這是因?yàn)轱@微細(xì)胞圖像的對(duì)比度低,在其直方圖中呈現(xiàn)單峰,導(dǎo)致閾值選取困難,分割效果不理想。

005.jpg

  最后利用本文的分割方法對(duì)顯微細(xì)胞圖像進(jìn)行分割,效果如圖5所示。由實(shí)驗(yàn)效果圖可以看到,利用本文的分割方法能夠較好地將顯微細(xì)胞圖像中的有形成分區(qū)域分割出來(lái),細(xì)胞邊緣較其他幾類方法完整,并且無(wú)其他雜點(diǎn)的存在,得到了較為精細(xì)的細(xì)胞有形成分二值圖像,這說(shuō)明本文的分割方法是比較好的。

5 結(jié)論

  本文研究比較了傳統(tǒng)的邊緣檢測(cè)及閾值分割法在顯微細(xì)胞圖像分割中的應(yīng)用,分析了分割結(jié)果,提出了一種改進(jìn)的二維最大熵閾值粗分割結(jié)合形態(tài)學(xué)精細(xì)分割的顯微細(xì)胞圖像有形成分優(yōu)化分割方法。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明該方法運(yùn)行速度快,能較好地分割出顯微細(xì)胞圖像有形成分區(qū)域,因此,本文的分割方法在醫(yī)學(xué)上具有一定的實(shí)用價(jià)值。

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