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基于胃鏡圖像的病灶區(qū)域檢測方法研究
來源:微型機與應用2014年第5期
關 沫,邢永吉
(沈陽工業(yè)大學 信息科學與工程學院,遼寧 沈陽 110023)
摘要: 提出了一種基于胃鏡圖像的計算機輔助病灶檢測方法。首先,引入超像素理論,將胃鏡圖像分割成大小均勻且包含相似像素的若干區(qū)域;然后,分別提取顏色特征和紋理特征,并將其融合作為特征描述符;最后,采用二級串聯(lián)分類器進行胃鏡圖像內(nèi)干擾區(qū)域的去除以及病灶區(qū)域的識別。實驗結(jié)果表明,本方法病灶檢測正確率(AUC)可達到91.588%。
Abstract:
Key words :

摘  要: 提出了一種基于胃鏡圖像的計算機輔助病灶檢測方法。首先,引入超像素理論,將胃鏡圖像分割成大小均勻且包含相似像素的若干區(qū)域;然后,分別提取顏色特征和紋理特征,并將其融合作為特征描述符;最后,采用二級串聯(lián)分類器進行胃鏡圖像內(nèi)干擾區(qū)域的去除以及病灶區(qū)域的識別。實驗結(jié)果表明,本方法病灶檢測正確率(AUC)可達到91.588%。
關鍵詞: 病灶檢測;顏色直方圖;超像素;LBP

 隨著人類生活方式和日常飲食的改變,加之現(xiàn)代生活快節(jié)奏性與不規(guī)律性,胃腸道疾病的發(fā)病率越來越高。目前,胃部疾病的檢測主要借助于電子胃鏡。醫(yī)學電子胃鏡主要由內(nèi)窺鏡、視頻處理器和視頻顯示器組成。應用電子胃鏡可以采集到高分辨率的醫(yī)學圖像,如圖1所示。臨床醫(yī)生可以靈活地操控電子胃鏡來實時地觀察胃鏡的病變區(qū)域。盡管如此,由于診斷過程主要憑借臨床醫(yī)生的主觀性,加之病理特征的多樣性和胃部環(huán)境的復雜性,胃病診斷的誤診率和漏診率仍居高不下。因此,研究與設計一種基于胃鏡圖像的計算機輔助檢測系統(tǒng)十分必要。

 就目前來看,此方面的研究主要集中在無線膠囊內(nèi)窺鏡圖像上,其研究的焦點主要集中于小腸和結(jié)腸的病灶區(qū)域檢測。而針對于傳統(tǒng)胃鏡圖像的研究尚處于起步階段,對于胃部病變的檢測尚未形成一種有效的方法??v觀前人的工作,雖然檢測方法多種多樣,但可以粗略概括為圖像預處理、特征提取和用分類器進行識別3個步驟。在圖像預處理階段,圖像通常會被分割成小矩形塊[1]或相互重疊的圓形區(qū)域[2];接下來,從分割后得到的區(qū)域提取各種不同特征,包括顏色直方圖、局部二進制模式(LBP)和小波域共生矩陣特征等。在最近幾年中,機器學習被廣泛地應用到醫(yī)學圖像的病灶檢測領域當中,例如支持向量機(SVM)[3]、貝葉斯推理和神經(jīng)網(wǎng)絡等。
 前人方法的主要缺陷在于過少地考慮了干擾因素的影響,提取特征相對單一。針對以上問題,本文提出了一種新的基于胃鏡圖像的病灶方法。首先,運用超像素的思想將圖像進行分割;然后,針對每一個分割后的區(qū)域,分別提取適合于排除干擾和識別病灶的組合特征;最后,采用二級串聯(lián)分類器進行干擾區(qū)域的去除和病灶區(qū)域的識別。
1 本方法中的相關技術
 胃腸道不同于人體其他器官,作為消化系統(tǒng)的一部分,它的生理環(huán)境十分復雜,其表面經(jīng)常會被粘液、氣泡和食物殘渣等覆蓋。除此之外,胃鏡的光照條件也極大地影響了圖像的質(zhì)量。綜合前人工作的分析可知,過多的噪聲極大地影響了病灶區(qū)域的識別準確率。針對此種情況,本文方法在圖像分割、特征提取以及分類器的設計上進行了相應改進。
1.1 基于超像素的區(qū)域劃分
 超像素在計算機視覺中得到了廣泛應用,但是在病灶檢測領域尚未得到應用。參考文獻[4]提出了一種簡單線性迭代聚集算法(SLIC)來減少計算量。相比較于歸一化分割算法和快速漂移算法,該算法具有耗時短、超像素的尺寸和矩形度可調(diào)節(jié)的特點。


    從實驗結(jié)果可以看出,對于干擾區(qū)域,15維的HIS_I、30維的HSV_HV、15維的Normalized RGB和15維的Opponent顏色特征表現(xiàn)出色,其受試者工作特征曲線(ROC曲線)下面積均可達到97.32%、98.78%、97.62%和99.27%。對于病灶區(qū)域,45維的HSV_HV、30維的RGB、45維的RG、15維的Opponent特征表現(xiàn)良好,其ROC曲線下面積均可達到90.76%、91.19%、92.83%和91.68%。然而單一的特征其代表性也比較單一,在實際復雜的應用環(huán)境中仍達不到理想的效果,因此本文方法將多種特征進行融合,通過多種特征的疊加來加強特征的魯棒性,從而可以應對復雜多變的應用環(huán)境,其實驗結(jié)果如圖2和圖3所示。圖2中,(1)表示HIS_I(15維)+HSV_HV(30維),NormRGB(45維)+OPPO(30維)+RGB(30維);(2)表示OPPO(30維)+LBP(15維);(3)表示OPPO(30維)+HUE(45維);(4)表示OPPO(30維)+HUE(45維)+LBP(15維);(5)表示所有單個特征表現(xiàn)最好的組合。圖3中,(1)表示HIS_I(45維)+LBP(30維)+NormRGB(45維)+HUE(45維);(2)表示LBP(30維),NormRGB(15維)+RG(30維);(3)表示LBP(30維)+NormRGB(45-d)+RG(45維)+OPPO(15維);(4)表示LBP(30維)+RG(30維);(5)表示LBP(30維)+RG(45維)+OPPO(45維);(6)表示RG(45維)+OPPO(15維)+RGB(30維);(7)表示RG(45維)+OPPO(15維)+RGB(30維)+LBP(30維);(8)表示所有單個特征表現(xiàn)最好的組合。

 實驗結(jié)果證明,其組合后的特征性能平均高于任何一個單一特征,達到了預期效果。在干擾區(qū)域排除階段,特征組合(2)(30維的Opponent顏色直方圖串聯(lián)15維的LBP紋理特征)表現(xiàn)最為突出,AUC達到99.50%。在病灶區(qū)域識別階段,特征組合(5)(30維LBP紋理特征串聯(lián)45維的RG和45維的Opponent顏色特征)表現(xiàn)出色,AUC達到93.34%。本方法最終采用以上兩種最優(yōu)特征組合方式,為后續(xù)的去除干擾和病灶識別工作奠定了基礎。
1.3 分類器設計
 Adaboost衍生于Boosting算法,自從Schapire提出以來得到了廣泛的應用。Adaboost屬于一種迭代算法,其核心思想是將多個弱分類器組合成一個強分類器。本文選取決策樹作為子分類器,為避免過度學習的情況發(fā)生,本文將樹的深度設置為2。其次需要確定算法迭代的次數(shù),綜合考慮算法的識別率及分類器的訓練時間,最終確定迭代次數(shù)為60最為合適。
 為減少胃鏡圖像中噪聲對檢測結(jié)果的影響,本文方法將兩個Adaboost分類器串聯(lián)起來,形成一個三分類器,通過此分類器,待檢測區(qū)域?qū)⒈蛔R別為正常區(qū)域、干擾區(qū)域或病灶區(qū)域3類。其工作流程如圖4所示。

2 方法實現(xiàn)
 首先,采用超像素的思想將圖像分割成像素相對緊湊一致的區(qū)域;其次,通過實驗分別找出適用于干擾區(qū)域和病灶區(qū)域的特征的組合;最后,采用二級分類器完成干擾區(qū)域的去除以及病灶區(qū)域的識別工作。本文方法的整個流程下。
算法:
?。?)設置期望的分割塊數(shù)K及區(qū)域的矩形度m。
?。?)在邊長為S的區(qū)域內(nèi)隨機初始化起始聚集中心CK=[lk,ak,bk,xk,yk]T。
?。?)采用3×3大小的鄰域?qū)ふ姨荻茸钚〉狞c作為聚集中心點。
?。?)repeat
 (5)for對于每一個中心點CK do
?。?)利用式(2),在中心點周圍2S×2S范圍內(nèi)尋找與中心點最匹配的像素點。
?。?)end for
 (8)重新計算中心點的位置,并計算新中心點與前中心點位置坐標的歐式距離E。
?。?)until E≤threshold
?。?0)將孤立存在的小區(qū)域強制劃分到相鄰的最大區(qū)域。
?。?1)for每一個分割后的區(qū)域do
?。?2)if區(qū)域內(nèi)像素個數(shù)≥N then
 (13)提取適合于干擾區(qū)域識別的特征組合。
?。?4)利用第一級分類器進行識別。
 (15)if該區(qū)域被識別為干擾區(qū)域then
?。?6)提取適合于病灶區(qū)域識別的特征組合。
 (17)利用第二級分類器進行識別。
?。?8)end if
?。?9)end if
?。?0)end for
3 實驗與結(jié)果分析
3.1實驗設計

 


 本實驗的數(shù)據(jù)來源于120個臨床病例,共計3 000張醫(yī)學胃鏡圖像,其中包含1 500張含有病灶區(qū)域的圖像和1 500張完全健康的圖像。圖像的大小為489像素×409像素,存儲格式為JPEG。每一幅含有病灶區(qū)域的圖像都配有專業(yè)醫(yī)師標注的標注圖,在實驗中作為地面真值。
 在實驗中,規(guī)定對于完全健康的圖像,只要有一個區(qū)域被識別為病灶區(qū)域,則認為檢測失??;反之,則認為檢測成功。對于含有病灶區(qū)域的圖像,只要有識別為病灶的區(qū)域與醫(yī)生標注區(qū)域有重疊,則認為檢測成功;否則,認為檢測失敗。
 在實驗中,采用4種不同的方法對相同一批圖像進行檢測,用來進行檢測效果的分析對比。方法1,SLIC分割+組合特征+二級串聯(lián)分類器;方法2,SLIC分割+組合特征+單級分類器;方法3:按30×30矩形分割圖像+組合特征+二級串聯(lián)分類器;方法4:按30×30矩形分割圖像+組合特征+單級分類器。
3.2 實驗結(jié)果與分析
 本文采用ROC曲線對實驗進行分析。ROC曲線將靈敏度與特異性以圖示方法結(jié)合在一起,可以準確反映分析方法中特異性和敏感性的關系,是試驗準確性的綜合代表。在ROC曲線圖表中,X軸表示假陽性率FPR(False Positive Rate),Y軸表示真陽性率TPR(True Positive Rate)。ROC曲線展示了當評判標準變化時這兩個變量之間的相互關系。ROC曲線下方的面積可以用來評判一個系統(tǒng)性能的好壞[5]。
實驗結(jié)果如圖5所示,本文所提出的方法(方法1)的檢測效果遠好于其他方法,其正確率遠好于其他3種方法,正確率(AUC)達到91.588%。方法2、方法3和方法4的正確率(AUC)分別為86.058%、76.458%和70.727%。


 部分實驗效果如圖6所示,其中第1排為含有病灶區(qū)域的胃鏡圖像;第2排為臨床醫(yī)師給出的地面真值圖;第3排為本文方法檢測后的結(jié)果圖。

 醫(yī)療器械的限制以及胃部特殊生理環(huán)境的影響,使得有些病灶區(qū)域很難用肉眼識別。考慮到胃鏡圖像的成像質(zhì)量受多方面因素的影響,圖像噪聲多的特點,本文方法在預處理階段采用SLIC分割算法,將圖像分割成大小均勻的超像素,相較于簡單的人工劃分區(qū)域,具有區(qū)域內(nèi)像素更加統(tǒng)一和緊湊的特點。此外,本文方法還采用了多種特征組合的形式替代了單一特征。最后通過使用二級串聯(lián)分類器將去干擾和病灶檢測步驟串聯(lián)進行。實驗表明,本文方法的病灶檢測正確率優(yōu)于傳統(tǒng)方法。
參考文獻
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